Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms