Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DPA1P20036 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms