Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DESP17661 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms