Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIM1P11309 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIM1P11309 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIM1P11309 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIM1P11309 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIM1P11309 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIM1P11309 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIM1P11309 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIM1P11309 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIM1P11309 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms