Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGAMP11215 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGAMP11215 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGAMP11215 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGAMP11215 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms