Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC4P09017 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms