Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms