Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms