Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms