Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms