Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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