Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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