Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms