Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms