Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms