Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB18Q9NP72 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms