Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC17Q9NP64 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms