Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms