Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms