Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SSBP4Q9BWG4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms