Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERAC1Q96JX3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms