Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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