Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms