Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms