Protein–RNA interactions for Protein: Q69YL0

NCBP2-AS2, Uncharacterized protein NCBP2-AS2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2-AS2Q69YL0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2-AS2Q69YL0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2-AS2Q69YL0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms