Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms