Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRIP1Q5VSL9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms