Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms