Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms