Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms