Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms