Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms