Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GBX1Q14549 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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