Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms