Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms