Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CKAP5Q14008 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CKAP5Q14008 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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