Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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LSAMPQ13449 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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LSAMPQ13449 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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