Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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