Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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