Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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