Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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