Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 949 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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AP1B1Q10567 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP1B1Q10567 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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