Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms