Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITIH3Q06033 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms