Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms