Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms