Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK11-1P61568 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms