Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3BP58499 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms