Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC5A3P53794 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms