Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ME1P48163 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ME1P48163 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ME1P48163 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms